for($i = 0; ($i < 10) && (strpos($str, '<!</ citation>!>') !== FALSE); ++$i)
                $str = preg_replace('`<!<(citation)\s*()?\s*>!>((?:.(?!<!< citation>!>))*)<!</ citation>!>`sU', '<span class="citation_auteur">Citation</span><div class="citation">\3</div>', $str);

while(avec ton strpos ...)

<?php
class vcode {
        public $tag_limit=array('\[','\]','[',']'); //Les 2premiers pour les regex les autres pour le vrai nom => pour les 2prem '[' devient '\[' car c'est un métacaractères
       
        //1 : Tag d'ouverture et de fermeture
        //2 : on met la regex de la valeur, si il ni a pas de valeur on met ''
        //3 : Fermeture de la balise
        //4 : Imbrication de balises de même nom à l'interieur
        //5 : Le html après le remplacement
        /////////////////////////////
        // Ex: array('gras','',true,false,'<strong>$1</strong>'),
        //[gras]string[/gras] -> <strong>string</strong>
        // Ex: array('quote','(="(.+)")?',true,true,'Citation : $2  $3'),       
        //[quote]string[/quote] -> Citation : <br ./> string
        //[quote="Robert"]string[/quote] -> Citation : Robert  string
        // Ex: array('ligne','',false,false,'<hr />'),   
        //[ligne] -> <hr />
        public $tags=array();
       
        public function config($file) {
                if(!file_exists($file)) return false;
                require_once($file);
                if(!empty($tag_limit)&&is_array($tag_limit)) $this->tag_limit=$tag_limit;
                if(!empty($tags)&&is_array($tags)) $this->tags=$tags;
                return true;
        }
       
        private function imbrique($reg,$tag) {
                $o=$tag[2].$tag[4];
                $c=$tag[2].'/'.$tag[4].$tag[3];
                while(strpos($this->str,$o)!==FALSE && strpos($this->str,$c)!==FALSE && strpos($this->str,$o)<strpos($this->str,$c) && strpos($this->str,$o)+strlen($o)<strpos($this->str,$c)) {
                        $ipr=substr($this->str,0, strpos($this->str,$o)).preg_replace('!'.$reg.'!isU', $tag[8], substr($this->str,strpos($this->str,$o)));
                        if(!empty($temp)&&$temp==$ipr) return true;
                        $this->str=$temp=$ipr;
                }
                return true;
        }
       
        public function parse() {
                foreach($this->tags as $tag) {
                        $reg=$this->tag_limit[0].$tag[0].$tag[1].$this->tag_limit[1];
                        if($tag[2]) $reg.='(.+)'.$this->tag_limit[0].'/'.$tag[0].$this->tag_limit[1];
                        if($tag[3]) $this->imbrique($reg,array_merge($this->tag_limit,$tag));
                        else $this->str=preg_replace('!'.$reg.'!isU',$tag[4],$this->str);
                }
                return $this->str;
        }
}
?>

<?php
require_once('vcode.php');
$vc=new vcode();
$vc->config('vcode.inc.php'); //Pour changer la config
echo $vc->parse('<gras >Message test</gras>'); //J'ai ajouter un espace a la balise pour ne pas avoir de remplacement sur le forum
?>

<?php
$tag_limit=array('<','>','<','>');


$tags=array(
        array('gras','',true,false,"<span class=\"vcode_gras\">$1</span>\n"),
        array('citation','(="(.+)")?',true,true,"<div class=\"vcode_bloc\">\n<div class=\"vcode_citation_auteur\">Citation : $2</div>\n<div class=\"vcode_citation\">\n$3\n</div>\n</div>"),
        array('ligne','',false,false,'<hr />')
);
?>